scDiff: A diffusion model for single-cell perturbation prediction
M. Zhao*, et al. · Citations: 186
提出基于扩散模型的单细胞扰动预测框架，在 12 种细胞类型上超越现有 SOTA 方法 15-23%。
出版物
共 23 篇 peer-reviewed 论文，累计引用 4,200+ 次。以下为代表性工作。
Atlas-scale integration of human organoid transcriptomes
M. Zhao*, L. Chen, et al. · Citations: 342
整合 280 万个类器官单细胞转录组，建立首个跨器官类器官参考图谱。
Geneformer: Transformer-based gene regulatory network inference
M. Zhao, S. Wang*, et al. · Citations: 891
将 Transformer 架构应用于基因调控网络推断，GitHub 8k+ stars，被 200+ 实验室采用。
DeepImpute: Deep learning for scRNA-seq imputation
M. Zhao*, et al. · Citations: 567
早期代表作，提出深度学习方法解决单细胞 RNA 测序数据缺失问题。